Pluma - это форк текстового редактора gedit.
У него такие же проблемы, как у его родоначальника.
Если открыть текстовые файлы созданные в Windows в кодировке Windows-1251, то вместо русских букв будут кракозябры.
Чтобы это исправить, откройте терминал и выполните следующую команду:

gsettings set org.mate.pluma auto-detected-encodings "['UTF-8', 'WINDOWS-1251', 'CURRENT', 'ISO-8859-15', 'UTF-16']"